MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium jeikeium K411 plasmid pKW4

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003080	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320555
2	NC_003080	A	6	6	243	248	100 %	0 %	0 %	0 %	15320555
3	NC_003080	CGG	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
4	NC_003080	GTA	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
5	NC_003080	GACC	2	8	372	379	25 %	0 %	25 %	50 %	15320555
6	NC_003080	GCA	2	6	381	386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320555
7	NC_003080	CTT	2	6	388	393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320555
8	NC_003080	CG	3	6	431	436	0 %	0 %	50 %	50 %	15320555
9	NC_003080	CAC	2	6	471	476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
10	NC_003080	CGT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
11	NC_003080	GTT	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320555
12	NC_003080	ATCGAC	2	12	568	579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15320555
13	NC_003080	CGG	2	6	594	599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
14	NC_003080	GCT	2	6	642	647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
15	NC_003080	CG	3	6	745	750	0 %	0 %	50 %	50 %	15320555
16	NC_003080	CAC	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
17	NC_003080	ACC	2	6	800	805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
18	NC_003080	CGG	2	6	807	812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
19	NC_003080	GAT	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
20	NC_003080	CGA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320555
21	NC_003080	ATC	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320555
22	NC_003080	TCG	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
23	NC_003080	CGTG	2	8	1350	1357	0 %	25 %	50 %	25 %	15320555
24	NC_003080	TAG	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
25	NC_003080	CCA	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
26	NC_003080	GGC	2	6	1465	1470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
27	NC_003080	ACT	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320555
28	NC_003080	GT	3	6	1664	1669	0 %	50 %	50 %	0 %	15320555
29	NC_003080	AAG	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320555
30	NC_003080	TCCC	2	8	1711	1718	0 %	25 %	0 %	75 %	15320555
31	NC_003080	GAAG	2	8	1727	1734	50 %	0 %	50 %	0 %	15320555
32	NC_003080	AAAT	2	8	1741	1748	75 %	25 %	0 %	0 %	15320555
33	NC_003080	CT	3	6	2778	2783	0 %	50 %	0 %	50 %	15320556
34	NC_003080	CA	3	6	2978	2983	50 %	0 %	0 %	50 %	15320556
35	NC_003080	ACAA	2	8	2984	2991	75 %	0 %	0 %	25 %	15320556
36	NC_003080	CAA	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
37	NC_003080	ACT	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
38	NC_003080	GC	3	6	3054	3059	0 %	0 %	50 %	50 %	15320556
39	NC_003080	CAA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
40	NC_003080	ATTCC	2	10	3143	3152	20 %	40 %	0 %	40 %	15320556
41	NC_003080	CTA	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
42	NC_003080	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
43	NC_003080	CAG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320556
44	NC_003080	AAG	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
45	NC_003080	CCG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320556
46	NC_003080	CCA	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320556
47	NC_003080	ACC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320556
48	NC_003080	CTCTC	2	10	3533	3542	0 %	40 %	0 %	60 %	15320556
49	NC_003080	AGA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
50	NC_003080	AGA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
51	NC_003080	CAT	2	6	3717	3722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
52	NC_003080	CAG	2	6	3782	3787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320556
53	NC_003080	TGA	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
54	NC_003080	TTC	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320556
55	NC_003080	AGA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
56	NC_003080	CCCA	2	8	3960	3967	25 %	0 %	0 %	75 %	15320556
57	NC_003080	AGT	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
58	NC_003080	TAC	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
59	NC_003080	TCCG	2	8	4054	4061	0 %	25 %	25 %	50 %	15320556
60	NC_003080	CAA	2	6	4111	4116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
61	NC_003080	AGT	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
62	NC_003080	TTC	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320556
63	NC_003080	TC	3	6	4171	4176	0 %	50 %	0 %	50 %	15320557
64	NC_003080	GTA	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320557
65	NC_003080	GAC	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320557
66	NC_003080	TTAG	2	8	4370	4377	25 %	50 %	25 %	0 %	15320557
67	NC_003080	ATC	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320557
68	NC_003080	TCT	3	9	4413	4421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320557
69	NC_003080	AGA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320557
70	NC_003080	AAT	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15320557
71	NC_003080	TAGAG	2	10	4523	4532	40 %	20 %	40 %	0 %	15320557
72	NC_003080	GCA	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320557
73	NC_003080	TCC	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320558
74	NC_003080	GTC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320558
75	NC_003080	GCT	2	6	4735	4740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320558
76	NC_003080	TC	3	6	4772	4777	0 %	50 %	0 %	50 %	15320558
77	NC_003080	TA	3	6	4811	4816	50 %	50 %	0 %	0 %	15320558
78	NC_003080	ACG	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320558
79	NC_003080	CCA	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320558
80	NC_003080	CA	3	6	5107	5112	50 %	0 %	0 %	50 %	15320558
81	NC_003080	TCT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320558
82	NC_003080	GTA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320558
83	NC_003080	TCT	2	6	5198	5203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320558
84	NC_003080	CCAC	2	8	5276	5283	25 %	0 %	0 %	75 %	15320558
85	NC_003080	CTATT	2	10	5303	5312	20 %	60 %	0 %	20 %	15320558
86	NC_003080	TCC	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320558
87	NC_003080	CAG	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320558
88	NC_003080	T	6	6	5506	5511	0 %	100 %	0 %	0 %	15320558
89	NC_003080	ACT	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320558
90	NC_003080	CCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320559
91	NC_003080	ATA	2	6	5604	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15320559
92	NC_003080	GAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320559
93	NC_003080	ATC	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320559
94	NC_003080	GAA	2	6	5868	5873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320559
95	NC_003080	GCGA	2	8	5919	5926	25 %	0 %	50 %	25 %	15320559
96	NC_003080	AGA	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320559
97	NC_003080	AGT	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320559
98	NC_003080	ATT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15320559
99	NC_003080	TG	5	10	6239	6248	0 %	50 %	50 %	0 %	15320559
100	NC_003080	ATTT	2	8	6279	6286	25 %	75 %	0 %	0 %	15320559
101	NC_003080	T	6	6	6316	6321	0 %	100 %	0 %	0 %	15320560
102	NC_003080	T	6	6	6345	6350	0 %	100 %	0 %	0 %	15320560
103	NC_003080	A	6	6	6386	6391	100 %	0 %	0 %	0 %	15320560
104	NC_003080	AGG	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320560
105	NC_003080	TCA	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320560
106	NC_003080	CGGCAA	2	12	6457	6468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320560
107	NC_003080	GGA	2	6	6514	6519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320560
108	NC_003080	GAT	3	9	6554	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320560
109	NC_003080	TGT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320560
110	NC_003080	GTA	2	6	6592	6597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320561
111	NC_003080	TTC	2	6	6682	6687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
112	NC_003080	TCT	2	6	6702	6707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
113	NC_003080	ACG	2	6	6791	6796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320561
114	NC_003080	TTC	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
115	NC_003080	ATC	2	6	7472	7477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320562
116	NC_003080	CTGT	2	8	7517	7524	0 %	50 %	25 %	25 %	15320562
117	NC_003080	GTTG	2	8	7536	7543	0 %	50 %	50 %	0 %	15320562
118	NC_003080	GGC	2	6	7558	7563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320562
119	NC_003080	CGC	2	6	7629	7634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320562
120	NC_003080	GGA	2	6	7683	7688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320562
121	NC_003080	CTCGG	2	10	7707	7716	0 %	20 %	40 %	40 %	15320562
122	NC_003080	GT	3	6	7723	7728	0 %	50 %	50 %	0 %	15320562
123	NC_003080	GGT	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15320562
124	NC_003080	TCG	2	6	7767	7772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320562
125	NC_003080	ACG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320562
126	NC_003080	TCG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320562
127	NC_003080	CTC	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320562
128	NC_003080	AGT	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320562
129	NC_003080	CCGA	2	8	8404	8411	25 %	0 %	25 %	50 %	15320563
130	NC_003080	CGAT	2	8	8440	8447	25 %	25 %	25 %	25 %	15320563
131	NC_003080	CTG	2	6	8460	8465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320563
132	NC_003080	GCC	2	6	8475	8480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320563
133	NC_003080	GAT	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320563
134	NC_003080	ACT	2	6	8627	8632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320563
135	NC_003080	TGT	2	6	8633	8638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320563
136	NC_003080	CAA	2	6	8761	8766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62420831
137	NC_003080	CGA	2	6	8782	8787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62420831
138	NC_003080	TTG	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62420831
139	NC_003080	CAC	2	6	8847	8852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62420831
140	NC_003080	CCCT	2	8	9475	9482	0 %	25 %	0 %	75 %	15320564
141	NC_003080	CGT	2	6	9579	9584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320564
142	NC_003080	TCA	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320564
143	NC_003080	AGCA	2	8	9627	9634	50 %	0 %	25 %	25 %	15320564
144	NC_003080	CTT	2	6	9636	9641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320564
145	NC_003080	TCTCG	2	10	9676	9685	0 %	40 %	20 %	40 %	15320564
146	NC_003080	AGT	2	6	9690	9695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320564
147	NC_003080	AGG	2	6	10099	10104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320565
148	NC_003080	CGG	2	6	10285	10290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320565
149	NC_003080	CTT	2	6	10348	10353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320565
150	NC_003080	CGT	2	6	10359	10364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320565
151	NC_003080	CGC	2	6	10388	10393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320565
152	NC_003080	CTG	2	6	10462	10467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320565
153	NC_003080	GTC	2	6	10968	10973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320566
154	NC_003080	TGG	2	6	10984	10989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15320566
155	NC_003080	ACG	2	6	11007	11012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320566
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158	NC_003080	CAT	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320566
159	NC_003080	TGA	2	6	11210	11215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320566
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162	NC_003080	AAGGG	2	10	11397	11406	40 %	0 %	60 %	0 %	15320566
163	NC_003080	GAC	2	6	12096	12101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320567
164	NC_003080	CGA	2	6	12170	12175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320567
165	NC_003080	GC	3	6	12182	12187	0 %	0 %	50 %	50 %	15320567
166	NC_003080	GCA	2	6	12199	12204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320567
167	NC_003080	AAG	2	6	12205	12210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320567
168	NC_003080	TCA	3	9	12211	12219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320567
169	NC_003080	CAT	2	6	12272	12277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320567
170	NC_003080	ACT	2	6	12279	12284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320567
171	NC_003080	CG	3	6	12290	12295	0 %	0 %	50 %	50 %	15320567
172	NC_003080	TC	3	6	12360	12365	0 %	50 %	0 %	50 %	15320567
173	NC_003080	TTC	2	6	12372	12377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320567
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176	NC_003080	TCC	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320567
177	NC_003080	GTC	2	6	12474	12479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320567
178	NC_003080	A	6	6	12492	12497	100 %	0 %	0 %	0 %	15320567
179	NC_003080	CATT	2	8	12509	12516	25 %	50 %	0 %	25 %	15320567
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199	NC_003080	CAA	2	6	14002	14007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320569
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.